【佳學基因檢測】高通量測序(NGS)基因檢測中擴增子的選擇、設(shè)計及優(yōu)化
在新一代基因測序(NGS),如何獲取更多的基因信息是基因解碼的先進步。獲取信息多、全、正確,才能做好基因解碼。根據(jù)佳學基因高通量測序技術(shù)研發(fā)中心介紹。在目前的高通量DNA測序(HTS)應(yīng)用中,擴增子測序一直是先進方法。但是很多基因測序機構(gòu)只是非常關(guān)注HTS提供的數(shù)據(jù)量迅速增長的分析方法及常說的生物信息分析方法。對于樣品制備的重要性和生成的測序文庫是否真實的反映了樣本基因序列的真實性缺乏關(guān)注。再多的、再復雜的、再炫酷的高端生物信息學也無法彌補制備不良的樣本,因此,在制定基因解碼過程中的基因測序標準流程中,佳學基因提出必須認真關(guān)注工作流程中的樣本制備和文庫生成,尤其是涉及多個PCR步驟的樣本制備和文庫生成。佳學基因付出大量精力,研究和探討擴增子工作流程中的實驗操作方面的常常出現(xiàn)的問題,以協(xié)調(diào)樣品采集、測序文庫制備工作中的各個環(huán)節(jié)。通過提供佳學基因總結(jié)收集的經(jīng)驗數(shù)據(jù)來說明問題存在范圍。賊后,從基因測序數(shù)據(jù)生成的實際情況,分析影響測序結(jié)果的各種參數(shù)。佳學基因介紹高通量測序的技術(shù)細節(jié)及分析流程的重要性,以實現(xiàn)有意義的、經(jīng)得起各種驗證的、可適當分析的數(shù)據(jù)。由于佳學基因?qū)U增子測序應(yīng)用到從法醫(yī)到環(huán)境DNA(eDNA),從致病基因的鑒定到靶向藥物的尋找,從腫瘤風險的預測到腫腫瘤微小殘留灶的檢測中,具備不斷發(fā)展的應(yīng)用和技術(shù)趨動力。因此,建立有效的工作流程極為重要。
不可否認,與高通量DNA測序(HTS)相關(guān)的無數(shù)名稱和首字母縮略詞給人留下了深刻的印象,而該技術(shù)本身被證明有用的應(yīng)用數(shù)量也與此相匹配。迄今為止,擴增子測序是許多HTS研究中的先進方法,通過該方法可以生成PCR產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化為文庫,合并然后測序。擴增子測序已被廣泛用于或擬用于多種環(huán)境,包括生物監(jiān)測、飲食分析和細菌宏基因組學。由于這項技術(shù)可以很容易地應(yīng)用于一系列學科,它有時會成為尋求利用它的科學家的雷區(qū)。對于那些在濕實驗室分子生物學技能或計算生物信息學方面經(jīng)驗有限的人來說尤其如此。這些領(lǐng)域中的后一個受到了廣泛關(guān)注;前者的重要性常常被低估。