大多數(shù)癌癥的特征是基因組的不穩(wěn)定性，被認為是推動腫瘤發(fā)展與惡化的重要因素之一。癌細胞依賴于單個或幾個癌基因的增殖和存活的活性。基因擴增、轉錄或翻譯會引起致癌基因和腫瘤抑制因子活性的改變。癌癥相關蛋白質相互作用的表現(xiàn)結果，使我們對致癌作用的分子機制有了更多的理解。研究的結果發(fā)現(xiàn)了驅動癌癥突變的新型癌癥相關基因和功能相關基因。
 

賊近，人們通過分析了疾病和癌癥相關蛋白的結構復合物，發(fā)現(xiàn)了疾病相關蛋白復合物具有不同的結合特性，也就是能夠與許多其他蛋白質相互作用，對癌癥錯義突變有著特別顯著的趨勢。這些研究通常強調癌癥突變對蛋白質相互作用的影響的重要性。
 

許多致癌基因，腫瘤抑制因子及其突變，已被確定為癌癥的關鍵參與者。在癌癥中起重要作用的許多蛋白質也可能參與信號通路，通常通過磷酸化介導信號。然而磷酸化會導致蛋白質活化或失活，并調節(jié)蛋白質或DNA相互作用的強度。因此，磷酸化位點的突變可能導致這些重要功能特性的喪失，例如P53中調節(jié)結合DNA的磷酸化位點Ser 313的缺失。
 

同時，錯義突變也可能在癌變過程中起著非常重要的作用。許多研究表明，錯義突變可能在不同疾病中起著非常重要的作用，特別是對于多基因疾病來說還是比較復雜的。癌癥相關突變會呈現(xiàn)出不同的模式，突變是會影響生物分子相互作用的，人們發(fā)現(xiàn)涉及具有突變的蛋白質的相互作用通常傾向于發(fā)生在罕見的聚集區(qū)域中。
 

對于復雜的疾病或腫瘤，人們根據(jù)目前已有的數(shù)據(jù)庫無法分析并找出致病原因，但是基因解碼可以做到不利用數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)信息，直接對基因序列進行分析與解讀，并結合臨床表型等因素更多分析，找到發(fā)病原因，提供治療方案。